Тайный советник (с 30.08.1810). Из малороссийского дворянского рода. Сын сотника Григория Фёдоровича Лизакевича (?-1772) от брака с Ульяной Стефановной Уманец, брат А.Г. Лизакевича. Поступил на службу в Государственную коллегию иностранных дел в 1758. С 1760 прикомандирован к миссии в Гааге. В 1764 Лизакевич был переведен в миссию в Лондоне и работал в британской столице вплоть до октября 1800 (с перерывом в 1770 – 1771). С 1766 – переводчик, в 1770 произведён в титулярные советники.
В 1770 – 1771 Лизакевич принимал участие в 1-й Архипелагской экспедиции русского флота, предпринятой в ходе русско-турецкой войны 1768-1774.
В 1775 был назначен советником посольства в Лондоне. В качестве поверенного в делах неоднократно замещал посланников в Лондоне (в 1775-1777, 1778, 1785, 1800). 7.04.1782 произведён в канцелярии советники, 1.01.1793 - в статские советники, 23.02.1799 - в действительные статские советники.
В 1800 имп. Павел I расторг союз с Англией и порвал с ней дипломатические отношения. В августе 1800 Лизакевич был назначен посланником в Дании и в сентябре того же года по указанию из С.-Петербурга спешно покинул Великобританию с паспортом на другое имя. Российскую миссию в Дании Лизакевич возглавлял вплоть до 1815.
Лизакевич был кавалером российских орденов (Св.Анны 1-й ст., Св.Владимира 4-й ст.).
