Надворный советник. Сын Карла-Людвига Амбургера (1743-1817), выходца из Висбадена, в 1770 поселившегося в России, принявшего российское подданство и вступившего в 1-ю гильдию московского купечества, от брака с Софией Генриеттой Лербасс (1753-1828). Родился в С.-Петербурге. В 1818 поступил канцелярским служащим (актуариусом) в русскую миссию в Персии, где познакомился с А.С. Грибоедовым. 23.10.1818 был секундантом Грибоедова в его дуэли с А.И. Якубовичем. В 1826-1827 поверенный в делах в российской миссии в Тегеране, с 25.04.1827 генеральный консул в Тебризе, на этом посту, по оценке Грибоедова, действовал «очень умно и усердно». Участвовал в подготовке и заключении (1828) Туркманчайского мира, завершившего русско-персидскую войну 1826-1828. После разгрома российской миссии в Тегеране и убийства А.С. Грибоедова 30.01.1829 потребовал выдачи тел погибших, 6.03.1829 доносил о разгроме посольства главноначальствующему на Кавказе И.Ф. Паскевичу, 1.05.1829 встречал гроб с телом Грибоедова на границе с Персией и сопровождал его от Нахичевани до Тифлиса. За службу награждён орденом Св. Владимира 4-й степ. (16.11.1826) и персидским орденом Льва и Солнца 2-й степ. Скончался в Тебризе во время эпидемии холеры.
Грибоедов писал об Амбургере своему другу С.Н. Бегичеву: «Мой товарищ — особа прегорячая, бич на смотрителей, хороший малый; я уже уверил его, что быть немцем очень глупая роль на сем свете, и он уже подписывается Амбургев, а не -р, и вместе со мною немцев ругает наповал, а мне это с руки».